34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1033 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1033  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  788    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.177021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0605  hypothetical protein  82.32 
 
 		 397 aa  647    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1014  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  788    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0644  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.535291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1626  major facilitator superfamily MFS_1  20.96 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  23.4 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1835  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2304  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  24.49 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  24.49 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  24.49 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  23.87 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  24.49 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  24.49 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0561  major facilitator transporter  20.59 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  21.97 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.29 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 504 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  25.08 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  20.47 
 
 		 447 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  21.97 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  21.97 
 
 		 506 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  20.32 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  21.05 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  22.62 
 
 		 505 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 416 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>