41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2088 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  45.12 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.71 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  41.56 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.25 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  44.26 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  41.27 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.62 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44.07 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  41.03 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  36.71 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.76 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  39.24 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.97 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2489  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  38.75 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.75624  normal  0.124302 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3749  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  40.24 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359793  normal  0.747078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.5 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.43 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1824  hypothetical protein  35.21 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3810  hypothetical protein  38.98 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.35 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.16 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3498  hypothetical protein  37.29 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2661  hypothetical protein  33.82 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  35.9 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2541  hypothetical protein  31.71 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183876  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3066  hypothetical protein  33.8 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02722  hypothetical protein  37.29 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  28.12 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  35.38 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  32.81 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06880  hypothetical protein  26.98 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.613488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>