33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1419 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1419  acyltransferase 3  100 
 
 
386 aa  749    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  30.7 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  24.87 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  24.87 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  24.87 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  24.87 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  24.87 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  24.87 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  24.87 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  24.87 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  24.87 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1173  glucans biosynthesis protein  26.26 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  25.82 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  25.82 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  25.82 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  25.94 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  26.11 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  25.82 
 
 
384 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1302  acyltransferase 3  34.39 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390564  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1649  MDO-like protein  37.37 
 
 
408 aa  63.5  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  37.62 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6950  glucans biosynthesis protein  35.11 
 
 
478 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.91383  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1633  putative acyltransferase 3 family protein  35.14 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1112  acyltransferase 3  30.68 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0394  acyltransferase 3  29.89 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2068  acyltransferase 3  30.41 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0262  acyltransferase 3  29.7 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0106405 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  28.81 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3708  hypothetical protein  33.17 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6623  acyltransferase 3  33.86 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464195  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6143  hypothetical protein  33.07 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673704  normal  0.577249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5778  hypothetical protein  33.07 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.009732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2447  hypothetical protein  23.78 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>