19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3675 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  34.89 
 
 
263 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  37.76 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  34.11 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  33.7 
 
 
274 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  32.71 
 
 
274 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  29.58 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  27.7 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  31.72 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  29.38 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  26.76 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  31.23 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  25 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  24.28 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  27.6 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  31.78 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  29.08 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>