25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3570 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 65 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  58.93 
 
 		 58 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6363  hypothetical protein  65.45 
 
 		 59 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0923  hypothetical protein  62.26 
 
 		 62 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1293  regulatory protein MerR  54 
 
 		 59 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  49.21 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  42.59 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  51.79 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  45.28 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2294  hypothetical protein  40.82 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  39.22 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  37.25 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1800  hypothetical protein  42.03 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  37.25 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  37.25 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  37.25 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>