13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2694 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2694  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  471  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225762  hitchhiker  0.000408142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2510  hypothetical protein  49.09 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  53.85 
 
 		 1253 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  31.53 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  40.3 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  41.18 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  41.18 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5200  hypothetical protein  38.81 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.540164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  38.46 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  34.74 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  40.91 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3150  hypothetical protein  35.8 
 
 		 167 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>