14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2686 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  90.38 
 
 		 239 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  62.42 
 
 		 162 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  62.34 
 
 		 160 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  63.19 
 
 		 164 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  60.14 
 
 		 151 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  59.72 
 
 		 155 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  55.83 
 
 		 167 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.89 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  46.85 
 
 		 157 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  29.49 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 316 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  25.38 
 
 		 144 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0022  cyclase/dehydrase  28.44 
 
 		 155 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>