22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2357 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  94.85 
 
 		 97 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  70.65 
 
 		 96 aa  130  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2422  hypothetical protein  67.74 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1183  hypothetical protein  64.58 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  62.35 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  64.29 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.63 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.25 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  40.85 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  61.76 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  31.91 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.03 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.03 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  28.75 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  32.65 
 
 		 101 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  54.29 
 
 		 63 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>