44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2180 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2696  hypothetical protein  70.29 
 
 		 154 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18359  normal  0.148918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6998  hypothetical protein  67.39 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83128  hitchhiker  0.00920561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0552  hypothetical protein  65.73 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4082  hypothetical protein  66.18 
 
 		 152 aa  194  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6350  putative enediyne biosynthesis protein  64.29 
 
 		 165 aa  193  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  hitchhiker  0.000308521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0692  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  57.66 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0865  hypothetical protein  53.33 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0862335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0599  thioesterase-like protein  44.85 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  35.63 
 
 		 2888 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3014  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 604 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.42 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4041  hypothetical protein  23.48 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3928  hypothetical protein  23.48 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7078  hypothetical protein  30.61 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  29.77 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5607  hypothetical protein  28.71 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.368142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  31.97 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.9 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.69 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3507  hypothetical protein  28.24 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00249299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.29 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  27.96 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  29.77 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.28 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.48 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 		 149 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.47 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  26.44 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.59 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.07 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  29.92 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0988  thioesterase family protein  21.6 
 
 		 124 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0576476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>