More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1544 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  100 
 
 
320 aa  656    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  90.31 
 
 
503 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  58.93 
 
 
379 aa  361  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  54.83 
 
 
321 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  57.19 
 
 
320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  52.65 
 
 
322 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  54.41 
 
 
334 aa  345  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  56.19 
 
 
320 aa  342  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  52.45 
 
 
328 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  53.4 
 
 
328 aa  328  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  51.71 
 
 
334 aa  315  6e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  50.31 
 
 
330 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  50 
 
 
330 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  50 
 
 
341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  49.85 
 
 
331 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  46.56 
 
 
322 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  44.92 
 
 
321 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.11 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  47.35 
 
 
321 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  48.83 
 
 
322 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.8 
 
 
318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  50.39 
 
 
260 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  38.68 
 
 
330 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  41.61 
 
 
322 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  39.18 
 
 
318 aa  235  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  43.44 
 
 
321 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 
324 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  40.94 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  38.44 
 
 
318 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.2 
 
 
318 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  40.25 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  40.86 
 
 
321 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  35 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  37.04 
 
 
338 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 
332 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  35.52 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.84 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  33.13 
 
 
334 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.35 
 
 
329 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  34.78 
 
 
320 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  36.34 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  33.64 
 
 
328 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  36.25 
 
 
343 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 
325 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  35.62 
 
 
343 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  34.13 
 
 
332 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  33.44 
 
 
326 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  32.5 
 
 
321 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  32.11 
 
 
329 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  35.4 
 
 
320 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  31.34 
 
 
342 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  35.09 
 
 
320 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  34.24 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.75 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  32.93 
 
 
329 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  31.25 
 
 
338 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  44.5 
 
 
360 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.73 
 
 
333 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 
332 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 
333 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  31.85 
 
 
336 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  32.01 
 
 
335 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  31.36 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  32.92 
 
 
329 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  32.92 
 
 
329 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  32.92 
 
 
329 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.58 
 
 
326 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  31.75 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  32.63 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  31.85 
 
 
336 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.72 
 
 
332 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  32.4 
 
 
325 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  29.43 
 
 
330 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  33.85 
 
 
325 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.21 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  30.95 
 
 
336 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  30.95 
 
 
336 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  30.95 
 
 
336 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.04 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.72 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  33.64 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.87 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  30.22 
 
 
321 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  37.17 
 
 
325 aa  113  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  55.56 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.82 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  33.66 
 
 
339 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  36.53 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  33.33 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  34.86 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  32.08 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.02 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  30.09 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  36.36 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  36.36 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.76 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  36.36 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  35.76 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  32.8 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>