23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0372 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  100 
 
 
124 aa  247  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  91.94 
 
 
124 aa  208  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  70 
 
 
146 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  70.83 
 
 
129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  69.17 
 
 
120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  66.67 
 
 
120 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  64.41 
 
 
120 aa  151  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  66.67 
 
 
120 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  64.41 
 
 
127 aa  150  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  62.5 
 
 
120 aa  150  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  59.32 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  42.74 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  29.2 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  33.05 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  27.97 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  28.83 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  27.19 
 
 
121 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  29.41 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  33.33 
 
 
192 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  33.33 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  23.53 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  31.3 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>