67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2536 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2536    100 
 
 		 950 bp  1883    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 951 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 951 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 990 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 951 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 951 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 951 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 984 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 951 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  81.03 
 
 		 951 bp  339  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  80.9 
 
 		 990 bp  331  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  80.76 
 
 		 951 bp  323  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  82.12 
 
 		 861 bp  317  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  82.12 
 
 		 990 bp  317  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  84.49 
 
 		 462 bp  176  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  83.26 
 
 		 567 bp  157  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  77.98 
 
 		 912 bp  155  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  78.95 
 
 		 966 bp  149  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  92.16 
 
 		 1047 bp  139  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0676    92.16 
 
 		 1031 bp  139  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  92.16 
 
 		 993 bp  139  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  92.16 
 
 		 993 bp  139  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  92.16 
 
 		 1068 bp  139  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  92.16 
 
 		 993 bp  139  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2747    92.16 
 
 		 1062 bp  139  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0487379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  92.16 
 
 		 993 bp  139  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  78.73 
 
 		 834 bp  137  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  91.18 
 
 		 993 bp  131  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    88.89 
 
 		 2579 bp  109  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    80.95 
 
 		 980 bp  79.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1157    86.75 
 
 		 396 bp  77.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  85.09 
 
 		 666 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  88.57 
 
 		 1392 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2572    89.23 
 
 		 99 bp  73.8  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5272    92.45 
 
 		 630 bp  73.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2676    88.06 
 
 		 672 bp  69.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  0.345661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  84.21 
 
 		 336 bp  67.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0371  hypothetical protein  87.69 
 
 		 252 bp  65.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4242    85.71 
 
 		 306 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.0765 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  80.47 
 
 		 387 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  89.29 
 
 		 798 bp  63.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  85.53 
 
 		 960 bp  63.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  85.53 
 
 		 960 bp  63.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  85.53 
 
 		 513 bp  63.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  85.53 
 
 		 960 bp  63.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  85.53 
 
 		 960 bp  63.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7821    93.02 
 
 		 213 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2570    90.2 
 
 		 66 bp  61.9  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2781    84.34 
 
 		 579 bp  61.9  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2999    90 
 
 		 405 bp  60  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  87.1 
 
 		 252 bp  60  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  82.95 
 
 		 162 bp  56  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  87.76 
 
 		 594 bp  50.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  85.25 
 
 		 966 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7987    96.55 
 
 		 927 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1610    82.95 
 
 		 167 bp  48.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.382467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3548  hypothetical protein  88.64 
 
 		 297 bp  48.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1438    93.75 
 
 		 312 bp  48.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  100 
 
 		 621 bp  48.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1276  hypothetical protein  93.75 
 
 		 345 bp  48.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  96.43 
 
 		 537 bp  48.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>