More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1756 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1756  transposase  100 
 
 
82 aa  174  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  77.5 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  76.25 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  75.95 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  74.39 
 
 
160 aa  128  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  73.17 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  70.89 
 
 
156 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  67.09 
 
 
136 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1667  transposase IS200-family protein  69.62 
 
 
84 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.729393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  65 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  65.82 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  65.82 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  65.82 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  65.82 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  62.2 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
154 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
154 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
154 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
154 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1048  transposase  63.75 
 
 
170 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777104  normal  0.0145737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
154 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
154 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  63.41 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3316  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
137 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0104  IS605 family transposase  63.75 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.78108e-62  hitchhiker  1.21506e-131 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0057  IS605 family transposase  63.75 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.12196e-96  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0617  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000906641  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0279  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
152 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000713801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2227  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835855  hitchhiker  0.00464434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1972  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2631  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
152 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000741775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2889  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
152 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3209  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
152 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000115009  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1554  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3173  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
152 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.616713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2234  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
152 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.893496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0333  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000846816  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0848  transposase IS200-family protein  63.75 
 
 
152 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2661  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000522889  hitchhiker  0.00627277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2598  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1279  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000981056  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1222  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0736  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0335566  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2618  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.361666  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2584  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000573294  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2613  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3869  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000363831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0103  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0340  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0119674  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0116  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1827  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1487  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.242166  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1439  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.413019  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1357  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0501528  decreased coverage  0.000176837 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1609  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0741274  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1602  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1610  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0122723  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1138  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.130419  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3198  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225363  hitchhiker  0.00159351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3398  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2455  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2469  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.627217  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2528  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2303  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.906471  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3168  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1297  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1993  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1020  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0285  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2935  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.964844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2949  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.467669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3020  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3031  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000139818  normal  0.117471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3050  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129671  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3065  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3075  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3134  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3159  IS1541 transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1768  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000130923  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1967  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733038  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2877  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3127  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.53689  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  63.75 
 
 
169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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