21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0576 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0576  hypothetical protein  100 
 
 
996 aa  1999    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0045  adhesion exoprotein  34.93 
 
 
3692 aa  146  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1725  hypothetical protein  35.8 
 
 
1993 aa  96.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0575  hypothetical protein  73.47 
 
 
94 aa  81.6  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.99 
 
 
2449 aa  78.6  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 
428 aa  65.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0939  adhesion exoprotein  25.48 
 
 
615 aa  56.2  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000746139  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0044  adhesion exoprotein  23.68 
 
 
873 aa  54.7  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0410  adhesion exoprotein  29.92 
 
 
2457 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0143  adhesion exoprotein  35.34 
 
 
2823 aa  52  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0046  adhesion exoprotein  25.91 
 
 
985 aa  51.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  27.64 
 
 
688 aa  47.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.38 
 
 
2179 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  32.26 
 
 
459 aa  47  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  26.03 
 
 
2833 aa  46.2  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  30 
 
 
497 aa  46.2  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0027  hypothetical protein  50.79 
 
 
273 aa  46.2  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0944  adhesion exoprotein  23.33 
 
 
524 aa  45.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00559736  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1188  cell wall anchor domain-containing protein  35.17 
 
 
645 aa  45.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000565327  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1210  cell wall anchor domain-containing protein  35.17 
 
 
645 aa  45.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000311928  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.1 
 
 
2402 aa  44.7  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>