82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0166 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  100 
 
 		 1212 bp  482  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0166    100 
 
 		 243 bp  482  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  91.07 
 
 		 1227 bp  71.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1227    91.07 
 
 		 1208 bp  71.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1740    91.07 
 
 		 1077 bp  71.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0731895  normal  0.031178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  91.07 
 
 		 1227 bp  71.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  89.83 
 
 		 1227 bp  69.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  89.83 
 
 		 1227 bp  69.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  95.12 
 
 		 1251 bp  65.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00238  transposase, Mutator family  89.29 
 
 		 786 bp  63.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  89.29 
 
 		 1227 bp  63.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  89.29 
 
 		 1227 bp  63.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  89.29 
 
 		 1227 bp  63.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  89.29 
 
 		 1227 bp  63.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  89.29 
 
 		 1227 bp  63.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00290  transposase  94.74 
 
 		 294 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0508565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00428  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00515  IS1113 tranposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0127136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00578  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01463  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01962  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00540363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06261  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.190082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05637  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00105026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03988  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03663  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03164  IS1113 transposase  94.74 
 
 		 996 bp  60  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.800194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2550a    92.11 
 
 		 855 bp  52  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2119  putative transposase  86.21 
 
 		 219 bp  52  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  93.75 
 
 		 1251 bp  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  93.75 
 
 		 1251 bp  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0254    93.75 
 
 		 2624 bp  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  93.75 
 
 		 1251 bp  48.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  93.75 
 
 		 1251 bp  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  93.75 
 
 		 1251 bp  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  93.75 
 
 		 1251 bp  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  93.75 
 
 		 1251 bp  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  93.75 
 
 		 1251 bp  48.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  91.43 
 
 		 1248 bp  46.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  91.43 
 
 		 1275 bp  46.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2436    84.75 
 
 		 1208 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.636852  normal  0.0176396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2495    84.75 
 
 		 1155 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.186831  hitchhiker  0.00000352345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  84.75 
 
 		 1209 bp  46.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>