More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2119 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_2119  putative transposase  100 
 
 
72 aa  146  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0930  transposase, mutator type  58.33 
 
 
259 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385661  hitchhiker  0.00180839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0957  transposase, mutator type  58.33 
 
 
259 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209569  unclonable  0.0000397615 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  59.15 
 
 
404 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  59.15 
 
 
404 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.365641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1364  transposase, mutator type  59.15 
 
 
268 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.29614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  59.7 
 
 
402 aa  94  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  56.94 
 
 
402 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  58.33 
 
 
289 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  53.52 
 
 
404 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  53.52 
 
 
404 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  53.52 
 
 
404 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  53.52 
 
 
404 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  53.52 
 
 
404 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  53.52 
 
 
404 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  53.52 
 
 
404 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  53.52 
 
 
404 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  54.93 
 
 
402 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  54.93 
 
 
402 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  54.93 
 
 
402 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  54.93 
 
 
402 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  56.34 
 
 
402 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  52.11 
 
 
404 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  52.11 
 
 
404 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  52.11 
 
 
404 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  50 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2291  transposase  56.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0059921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1258  transposase, Mutator family  54.93 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  54.41 
 
 
435 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0141  transposase, mutator type  52.86 
 
 
266 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  52.94 
 
 
408 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  52.94 
 
 
408 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  47.06 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  48.53 
 
 
408 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  48.53 
 
 
408 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  48.53 
 
 
408 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  48.53 
 
 
408 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  48.53 
 
 
408 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5434  transposase, mutator type  41.43 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  48.53 
 
 
408 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  48.53 
 
 
408 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  45.59 
 
 
416 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  45.59 
 
 
416 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  45.59 
 
 
416 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  44.29 
 
 
416 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  44.12 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  44.12 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  44.12 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  44.12 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  44.12 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  44.12 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  44.12 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  44.12 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1824  transposase, mutator type  42.86 
 
 
403 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  45.59 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  44.12 
 
 
411 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  43.06 
 
 
407 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  44.12 
 
 
416 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  42.65 
 
 
406 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  44.12 
 
 
416 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>