20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1839 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  62.45 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  57.14 
 
 		 276 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  56.04 
 
 		 276 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  55.76 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  55.4 
 
 		 281 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  51.37 
 
 		 265 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  40.8 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  34.75 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  36.55 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  36.48 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  36.1 
 
 		 266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  35.14 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.21 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2051  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>