56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2914 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  62.37 
 
 		 551 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  99.29 
 
 		 567 aa  1161    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  98.94 
 
 		 567 aa  1160    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  100 
 
 		 567 aa  1168    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  54.85 
 
 		 565 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  35.74 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  38.12 
 
 		 541 aa  346  7e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  40.37 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  40.06 
 
 		 323 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  32.39 
 
 		 364 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  33.91 
 
 		 359 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  33.62 
 
 		 359 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  33.55 
 
 		 321 aa  170  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  36.84 
 
 		 360 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1304  hypothetical protein  32.88 
 
 		 230 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0742  hypothetical protein  33.92 
 
 		 229 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.10229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1447  hypothetical protein  33.63 
 
 		 228 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  36.67 
 
 		 232 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05048  hypothetical protein  29.78 
 
 		 229 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2744  hypothetical protein  33.63 
 
 		 228 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.950913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5075  hypothetical protein  34.65 
 
 		 230 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0681  hypothetical protein  33.62 
 
 		 232 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0721  hypothetical protein  31.28 
 
 		 225 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  46.15 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0262  hypothetical protein  31.72 
 
 		 233 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  37.91 
 
 		 231 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0565  hypothetical protein  28.14 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.465028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  48.81 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  32.09 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  27.05 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  24.9 
 
 		 641 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  27.21 
 
 		 646 aa  54.3  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  24.28 
 
 		 240 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  26.13 
 
 		 794 aa  51.6  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  26.09 
 
 		 668 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  24.26 
 
 		 602 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  23.23 
 
 		 771 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  51.92 
 
 		 58 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  25.99 
 
 		 668 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 		 642 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  30 
 
 		 241 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 		 669 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  24.36 
 
 		 780 aa  47.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  22.65 
 
 		 683 aa  47  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  22.76 
 
 		 656 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  21.64 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  19.61 
 
 		 683 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  22.67 
 
 		 724 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 661 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  26.44 
 
 		 661 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 661 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 661 aa  43.9  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 661 aa  43.9  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 661 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 661 aa  43.9  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 661 aa  43.9  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>