13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0612 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  104  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  56.6 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  46 
 
 
99 aa  52  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  45.1 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  47.06 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  47.06 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  48.94 
 
 
247 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  53.33 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  41.51 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  45.28 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  45.28 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  45.24 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>