74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2722 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2722  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  434  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0527  hypothetical protein  42.92 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.35 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.63 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.38 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0383  GPR1/FUN34/YaaH family protein  32.27 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  29.73 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.69 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.15 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.41 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.26 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.81 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  33.86 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.99 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.34 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.1 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.87 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  31.63 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  28.04 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  28.04 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  29.63 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  27.84 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.65 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.8 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.47 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.51 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  27.13 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  27.13 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3251  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.51 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000382822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  27.59 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  27.13 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  27.13 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  27.13 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3556  hypothetical protein  27.51 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000310297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3245  GPR1/FUN34/YaaH family protein  26.98 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  28.71 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.03 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  27.89 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  29.65 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  29.79 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.32 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  27.88 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  25.93 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  26.6 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.37 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  26.06 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.37 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  26.06 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  26.06 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  26.06 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  26.06 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.65 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.06 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  26.06 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  29.57 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  27 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.64 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.75 
 
 		 199 aa  42  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  29.38 
 
 		 200 aa  42  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  25.82 
 
 		 183 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.95 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  25.53 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>