13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2619 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2619  cupin 2, barrel  100 
 
 		 120 aa  229  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1298  cupin 2 domain-containing protein  35.85 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18080  cupin domain-containing protein  38.46 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.259998  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0012  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  31.82 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>