66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2566 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 
203 aa  394  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0747  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  38.07 
 
 
219 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  25.75 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4029  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2944  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  35.87 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  34.38 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  28.69 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
216 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  32.43 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  40 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  25.2 
 
 
219 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0010  DsbA oxidoreductase  36 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  31.94 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2002  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.33 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  28.19 
 
 
336 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2023  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1792  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000899943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1918  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.017598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1780  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00151932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
305 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1759  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.29 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1954  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000322125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1922  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  38.81 
 
 
300 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  36.51 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0010  DSBA oxidoreductase  36 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1737  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.29 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563102  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0010  DSBA oxidoreductase  36 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  27.45 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  33.75 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0754  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  35.38 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  30.43 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3421  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  31.25 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000359947 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.2 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  33.98 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  39.68 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  34.02 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0131  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  32.31 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3220  hypothetical protein  27.56 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147691  hitchhiker  0.000408835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  33.85 
 
 
200 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
237 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 
263 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  25.93 
 
 
319 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
221 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  28.4 
 
 
242 aa  41.2  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2726  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 
219 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421969  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  28.4 
 
 
200 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  28.15 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  28.4 
 
 
238 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>