27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1533 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  50.41 
 
 		 170 aa  117  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  37.01 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0626  hypothetical protein  38.03 
 
 		 143 aa  112  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  36.09 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  38.97 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  37.24 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1908  hypothetical protein  40.68 
 
 		 183 aa  91.7  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  42.99 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  34.71 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  29.46 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  40.43 
 
 		 823 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 806 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  41.67 
 
 		 325 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  36.21 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0508  hypothetical protein  36.21 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0574  hypothetical protein  36.21 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0329  hypothetical protein  34.48 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1375  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1894  type II secretion system protein E  40 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5058  group-specific protein  34.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5539  hypothetical protein  34.38 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1442  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.000931055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.62 
 
 		 388 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  32.39 
 
 		 129 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0680  hypothetical protein  17.42 
 
 		 310 aa  40.8  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>