More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1110 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  100 
 
 		 481 aa  963    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  64.81 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  62.66 
 
 		 478 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  65.5 
 
 		 474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  63.25 
 
 		 489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  66.07 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  58.64 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  59.05 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  59.83 
 
 		 470 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  59.31 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  58.1 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.7 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.7 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  59.64 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  59.73 
 
 		 476 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  59.82 
 
 		 474 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  59.65 
 
 		 461 aa  531  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  58.01 
 
 		 463 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.32 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  59.96 
 
 		 477 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  58.7 
 
 		 473 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  59.5 
 
 		 481 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3884  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  60.36 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  57.82 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  58.13 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  59.73 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  58.82 
 
 		 490 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  58.37 
 
 		 479 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1706  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  59.82 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.71 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  56.56 
 
 		 462 aa  514  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  59.64 
 
 		 500 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  58.41 
 
 		 473 aa  508  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  56.86 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  59.01 
 
 		 484 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.04 
 
 		 460 aa  504  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0554  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  58.01 
 
 		 463 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  57.4 
 
 		 457 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0264  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  61.42 
 
 		 461 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2955  malate dehydrogenase  54.57 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  56.18 
 
 		 485 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  54.75 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3529  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.38 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  58.21 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  57.95 
 
 		 399 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  58.21 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  57.95 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  57.95 
 
 		 399 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  57.95 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  57.95 
 
 		 399 aa  458  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  57.95 
 
 		 399 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  61.1 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  58.76 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.68 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  56.35 
 
 		 383 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.92 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  61.36 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  57.18 
 
 		 409 aa  445  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  57.33 
 
 		 409 aa  445  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  57.33 
 
 		 409 aa  445  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  59.69 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  62.71 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  59.38 
 
 		 390 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  61.94 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  59.13 
 
 		 403 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  54.79 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1647  malate dehydrogenase  50.88 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  60.05 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  58.12 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  58.12 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  58.56 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  61.76 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  57.33 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  57.07 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  57.07 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  57.07 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  58.49 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  57.33 
 
 		 412 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  59.53 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  56.81 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  57.07 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  57.07 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  57.07 
 
 		 402 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  57.07 
 
 		 402 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  57.33 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  61.46 
 
 		 396 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.91 
 
 		 384 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  56.56 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  56.81 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.71 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  58.51 
 
 		 411 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  53.96 
 
 		 752 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.97 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0794  NAD-dependent malic enzyme  54.03 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  57.33 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  59.42 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  55.05 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.74 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  51.86 
 
 		 759 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.58 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>