222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0252 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  100 
 
 
350 aa  707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  50.58 
 
 
342 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  49.57 
 
 
344 aa  341  9e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  47.09 
 
 
359 aa  296  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  44.57 
 
 
350 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  45.35 
 
 
355 aa  278  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  43.55 
 
 
350 aa  275  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  41.95 
 
 
384 aa  258  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  40.87 
 
 
352 aa  256  5e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  39.83 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  37.9 
 
 
346 aa  252  6e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  41.81 
 
 
362 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  41.45 
 
 
362 aa  247  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  42.57 
 
 
362 aa  246  6e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  43.06 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  38.33 
 
 
334 aa  237  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  39.07 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1702  peptidase M42 family protein  40.29 
 
 
341 aa  232  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  37.86 
 
 
350 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  35.82 
 
 
351 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  38.12 
 
 
349 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  40.76 
 
 
353 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  36.84 
 
 
362 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  36.55 
 
 
361 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  35.42 
 
 
334 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0680  peptidase M42 family protein  37.5 
 
 
336 aa  219  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  35.78 
 
 
348 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  35.07 
 
 
350 aa  216  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  36.42 
 
 
328 aa  215  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  38.6 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  36.36 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  34.09 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  36.26 
 
 
345 aa  212  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  39.36 
 
 
365 aa  212  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  34.21 
 
 
361 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  34.49 
 
 
350 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  32.96 
 
 
358 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  33.91 
 
 
350 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  34.21 
 
 
361 aa  209  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  34.21 
 
 
361 aa  209  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  34.21 
 
 
361 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  34.21 
 
 
361 aa  208  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  34.21 
 
 
361 aa  208  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  34.2 
 
 
350 aa  208  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  34.21 
 
 
361 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  34.78 
 
 
356 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  34.78 
 
 
356 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.78 
 
 
356 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  33.92 
 
 
361 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  33.92 
 
 
361 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.78 
 
 
356 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  34.78 
 
 
356 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  33.92 
 
 
361 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  33.92 
 
 
361 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  39 
 
 
345 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  38.42 
 
 
383 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  36.25 
 
 
336 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  38.76 
 
 
356 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.2 
 
 
356 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.2 
 
 
356 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.2 
 
 
356 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1103  Glutamyl aminopeptidase  39.09 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24305 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1758  peptidase M42 family protein  36.52 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  34.55 
 
 
348 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  34.01 
 
 
354 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  37.06 
 
 
352 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1701  peptidase M42 family protein  35.22 
 
 
331 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  36.94 
 
 
325 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  37.72 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  33.63 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0206  cellulase  35.65 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3414  peptidase M42 family protein  35.59 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  35.82 
 
 
354 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  36.47 
 
 
352 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  37.54 
 
 
353 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  35.26 
 
 
358 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  35.28 
 
 
349 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  37.39 
 
 
333 aa  193  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  34.48 
 
 
354 aa  192  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  35.36 
 
 
346 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  32.09 
 
 
358 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  32.09 
 
 
358 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  37.13 
 
 
359 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  35.59 
 
 
359 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  36.6 
 
 
360 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  34.23 
 
 
340 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  34.8 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  33.72 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  33.03 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  36.78 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  34.77 
 
 
356 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  35.47 
 
 
354 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  35.47 
 
 
353 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  35.47 
 
 
356 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  34.12 
 
 
339 aa  179  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  30.86 
 
 
334 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  37.79 
 
 
353 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  33.53 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  34.19 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3359  glutamyl aminopeptidase  33.72 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>