17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3365 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  98.72 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  34.06 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  34.06 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  24.83 
 
 
222 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  34.51 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  30.43 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  29.45 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  32.56 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  33.67 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  32.68 
 
 
163 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  28.03 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  27 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1053  gp11  27.27 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321055  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  24.22 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  29.89 
 
 
246 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>