15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4363 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4363  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104876  normal  0.566874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3358  hypothetical protein  54.89 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2057  hypothetical protein  50.7 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.689095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3576  hypothetical protein  41.86 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4231  hypothetical protein  41.86 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2918  hypothetical protein  39.13 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4436  hypothetical protein  33.57 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3359  hypothetical protein  40.52 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4001  hypothetical protein  35.85 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0372  hypothetical protein  33.98 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0026  hypothetical protein  25.93 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2060  hypothetical protein  34.09 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0278  conserved hypothetical cytosolic protein  34.15 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.472545  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  36.9 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  36.07 
 
 		 2159 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>