34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4222 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  176  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.24 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  38.75 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.67 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.35 
 
 		 83 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698152 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  39.76 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.24 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2489  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  38.55 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.75624  normal  0.124302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  43.28 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  46.97 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.33 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  44.44 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.613488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  37.8 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  44.19 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.74 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3749  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  50.82 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359793  normal  0.747078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.5 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2661  hypothetical protein  44.07 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  36.62 
 
 		 80 aa  42  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  32.91 
 
 		 80 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1824  hypothetical protein  43.08 
 
 		 84 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3810  hypothetical protein  42.62 
 
 		 84 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.84 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3498  hypothetical protein  40.98 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3066  hypothetical protein  39.34 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  32.95 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  40 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>