24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1757 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1757  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0248  hypothetical protein  42.54 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  43.41 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  37.96 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0996  gene transfer agent  29.1 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  32.35 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  31.58 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.07 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0367  hypothetical protein  40.4 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  32.58 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  34.07 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1887  hypothetical protein  31.11 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.526852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  29.55 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5448  hypothetical protein  37.62 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1173  gene transfer agent (GTA) like protein  28.79 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.777288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0284  hypothetical protein  28.78 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0594  hypothetical protein  28.95 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0593  hypothetical protein  28.95 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1426  hypothetical protein  30.48 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0396339  normal  0.212988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1700  hypothetical protein  30.48 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1422  hypothetical protein  31.03 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1367  hypothetical protein  28.47 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2606  gene transfer agent  31.31 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0897479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4289  gene transfer agent  32.63 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>