28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1524 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.412752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2822  putative precorrin methylase  80.95 
 
 		 124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1474  putative precorrin methylase  80.95 
 
 		 124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.22 
 
 		 547 aa  74.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2217  putative precorrin methylase  46.96 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0539  hypothetical protein  48.28 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.06 
 
 		 598 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  36.67 
 
 		 620 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  28.12 
 
 		 606 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.71 
 
 		 600 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  39.78 
 
 		 537 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3514  putative CobE protein  37.4 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2710  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  28.69 
 
 		 354 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329819  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  36.17 
 
 		 604 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.71 
 
 		 600 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1345  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.89 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3155  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  31.97 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  38.46 
 
 		 655 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  34.44 
 
 		 593 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  34.44 
 
 		 593 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3129  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  35.66 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2296  putative bifunctional protein (CbiGH)  42.11 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.0156989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2156  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  45.1 
 
 		 184 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0631744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1295  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  29.84 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0452493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.89 
 
 		 626 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1653  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.32 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1173  cobalamin biosynthesis protein CbiG  39.32 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4089  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  34.41 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>