107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1037 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1037  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 88 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2776  Acyl carrier protein, AcpP  97.73 
 
 		 88 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1418  phosphopantetheine-binding  97.73 
 
 		 88 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.819274  normal  0.36565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2147  phosphopantetheine-binding  80.72 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  73.26 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1220  phosphopantetheine-binding  73.81 
 
 		 85 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1242  phosphopantetheine-binding  67.14 
 
 		 70 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  40.96 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  43.21 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  46.55 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  46.55 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  43.64 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  49.02 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3760  hypothetical protein  38.6 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  44.23 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  39.24 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  32.95 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  39.24 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  45.1 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  38.16 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  41.3 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  43.64 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  39.62 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1173  phosphopantetheine-binding  35.53 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  40.35 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6195  NodF acyl carrier protein  28.72 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  36.23 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  33.73 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4914  phosphopantetheine-binding  31.82 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  46.3 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  37.97 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0517  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000044528  decreased coverage  0.00212296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  40.35 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2945  phosphopantetheine-binding  34.94 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0530278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5033  phosphopantetheine-binding  31.75 
 
 		 92 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  40.51 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  40.51 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  44.9 
 
 		 76 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 110 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0458  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.89611  normal  0.887307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 78 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 78 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 78 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  46.3 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  45.1 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  35.44 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  46 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0772  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000409893  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  33.8 
 
 		 2492 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  45.1 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  36.36 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  40 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3488  hypothetical protein  30.99 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  29.76 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  40 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  44.9 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  37.5 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>