19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3151 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
665 aa  1341    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  38.1 
 
 
653 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  40.44 
 
 
653 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  39.67 
 
 
651 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  38.16 
 
 
663 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  40.06 
 
 
656 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  37.09 
 
 
659 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  37.31 
 
 
632 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  35.92 
 
 
1032 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  35.92 
 
 
1032 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  34.94 
 
 
1018 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.21 
 
 
629 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  36.31 
 
 
631 aa  353  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  35.98 
 
 
631 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  32.57 
 
 
640 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  30.8 
 
 
671 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  33.28 
 
 
634 aa  279  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 
702 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  26.01 
 
 
349 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>