72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1194 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1194  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  57.3 
 
 		 230 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1402  protein of unknown function DUF134  47.46 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1957  hypothetical protein  55.43 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2417  protein of unknown function DUF134  44.74 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0233  protein of unknown function DUF134  45.79 
 
 		 154 aa  95.9  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0090  hypothetical protein  53.26 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1147  hypothetical protein  51.09 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  53.68 
 
 		 236 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0218  DNA-binding protein, putative  47.71 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.597835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_195  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0322712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1655  hypothetical protein  51.09 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00120133  hitchhiker  0.00648564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18270  predicted DNA-binding protein  47.83 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0135  hypothetical protein  52.17 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1340  hypothetical protein  46.74 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2279  protein of unknown function DUF134  51.11 
 
 		 192 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1343  protein of unknown function DUF134  46.67 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1003  hypothetical protein  47.87 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1492  hypothetical protein  45.56 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1249  protein of unknown function DUF134  43.62 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.928642  normal  0.573446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2090  DNA-binding proteins-like protein  40.8 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000200078  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2142  hypothetical protein  46.67 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1487  protein of unknown function DUF134  44.44 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0241794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0501  hypothetical protein  46.07 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1458  hypothetical protein  41.49 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.53934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0727  hypothetical protein  42.7 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000685  HTH DNA-binding protein  44.83 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0753  hypothetical protein  42.7 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1150  hypothetical protein  36.54 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3913  hypothetical protein  45.98 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2602  protein of unknown function DUF134  45.1 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000947411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0656  hypothetical protein  43.82 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0886  hypothetical protein  44.57 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.799321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0635  hypothetical protein  42.42 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0197  protein of unknown function DUF134  46.05 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3699  hypothetical protein  43.82 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1128  hypothetical protein  45.65 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0686  hypothetical protein  42.7 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0435  HTH DNA-binding protein  49.33 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1146  protein of unknown function DUF134  41.49 
 
 		 191 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0906  hypothetical protein  40.43 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1427  protein of unknown function DUF134  40.43 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3639  hypothetical protein  41.57 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0687  hypothetical protein  41.57 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0263195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0986  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0214647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1642  hypothetical protein  34.11 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.176572  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0272  hypothetical protein  34.11 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.185869  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2281  protein of unknown function DUF134  34.53 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.479687  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0881  protein of unknown function DUF134  38.3 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.451175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2819  hypothetical protein  42.7 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1391  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1428  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0587  hypothetical protein  39.56 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0627  protein of unknown function DUF134  40.22 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1410  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3434  protein of unknown function DUF134  39.08 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2217  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1981  protein of unknown function DUF134  32.76 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.427185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3018  hypothetical protein  38.04 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000905593  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0933  protein of unknown function DUF134  44.74 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2161  HTH DNA-binding protein  35.85 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0830  hypothetical protein  37.36 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0204  protein of unknown function DUF134  41.27 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2345  protein of unknown function DUF134  41.1 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0556  hypothetical protein  45.07 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.186851  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0048  hypothetical protein  37.36 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0730  hypothetical protein  39.18 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.736425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2435  hypothetical protein  48.39 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1974  putative DNA-binding protein  32.81 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1763  hypothetical protein  39.39 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1046  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442649  normal  0.956961 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0342  hypothetical protein  29.29 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0144063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>