14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0661 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0661  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.674805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  90 
 
 		 280 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1652  hypothetical protein  85 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2827  hypothetical protein  56.69 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.556996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2431  putative phage-related protein  50.35 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0249  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.06 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.819659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4140  hypothetical protein  40.33 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.923339  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0627  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  30.45 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0745757  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00122  putative phage-related protein  25.66 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.46 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.54 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.5 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4218  hypothetical protein  30.36 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4214  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.5 
 
 		 284 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.300379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>