More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3916 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3916  serine O-acetyltransferase  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.627699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2135  serine O-acetyltransferase  92.36 
 
 		 302 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3288  serine O-acetyltransferase  92 
 
 		 286 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3144  serine O-acetyltransferase  88.73 
 
 		 275 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2579  serine O-acetyltransferase  83.88 
 
 		 273 aa  484  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2176  serine O-acetyltransferase  82.35 
 
 		 276 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5231  serine O-acetyltransferase  81.82 
 
 		 275 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026757  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2063  serine O-acetyltransferase  71.37 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1729  serine O-acetyltransferase  69.41 
 
 		 272 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2401  serine O-acetyltransferase  69.2 
 
 		 285 aa  377  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_004310  BR1262  serine acetyltransferase  65.52 
 
 		 266 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1926  serine O-acetyltransferase  67.84 
 
 		 274 aa  377  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1765  serine O-acetyltransferase  66.92 
 
 		 277 aa  377  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1224  serine acetyltransferase 4 (atsat-4) (atserat3;2)  65.52 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2387  serine O-acetyltransferase  69.8 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2111  serine O-acetyltransferase  69.8 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1113  serine O-acetyltransferase  66.67 
 
 		 275 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.860963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2811  serine O-acetyltransferase  68.82 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1568  serine O-acetyltransferase  66.54 
 
 		 277 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2542  serine acetyltransferase  63.74 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0926  serine O-acetyltransferase  67.16 
 
 		 278 aa  371  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  0.148148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3774  serine O-acetyltransferase  65.66 
 
 		 283 aa  364  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0211  serine O-acetyltransferase  65.37 
 
 		 312 aa  351  8.999999999999999e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.248006  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3208  serine O-acetyltransferase  66.02 
 
 		 298 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2624  serine O-acetyltransferase  58.27 
 
 		 275 aa  333  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174291  normal  0.141631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1648  serine O-acetyltransferase  56.54 
 
 		 272 aa  322  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2161  serine O-acetyltransferase  54.96 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1091  serine O-acetyltransferase  54.05 
 
 		 268 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3299  serine acetyltransferase  56.92 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800758  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2481  serine O-acetyltransferase  52.9 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1146  serine O-acetyltransferase  52.9 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1075  serine O-acetyltransferase  53.88 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128961  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3752  serine O-acetyltransferase  54.3 
 
 		 288 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.547192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0792  Serine O-acetyltransferase  58.2 
 
 		 288 aa  293  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2885  serine O-acetyltransferase  53.54 
 
 		 279 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236188  normal  0.13112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1084  Serine O-acetyltransferase  50.36 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.183103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3979  serine acetyltransferase  54.65 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.423159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1067  serine O-acetyltransferase  53.33 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4085  serine acetyltransferase  54.26 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3917  serine acetyltransferase  54.26 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4024  serine acetyltransferase  54.26 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3898  serine acetyltransferase  54.26 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2225  serine acetyltransferase  54.15 
 
 		 273 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3403  serine O-acetyltransferase  54.3 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0128  serine acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25771  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03465  serine acetyltransferase  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0098  serine O-acetyltransferase  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4111  serine acetyltransferase  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03416  hypothetical protein  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3944  serine acetyltransferase  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4035  serine acetyltransferase  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3819  serine acetyltransferase  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0101  serine acetyltransferase  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4980  serine acetyltransferase  53.49 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002243  serine acetyltransferase  52.96 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4078  serine O-acetyltransferase  51.98 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00125  serine acetyltransferase  52.57 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4361  serine acetyltransferase  51.94 
 
 		 273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  54.09 
 
 		 273 aa  271  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0154  serine acetyltransferase  52 
 
 		 265 aa  271  9e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4136  serine acetyltransferase  52.73 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0181  serine acetyltransferase  52.34 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3938  serine acetyltransferase  52.34 
 
 		 273 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0074  serine acetyltransferase  52.34 
 
 		 274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00201  serine acetyltransferase  50.96 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2800  serine acetyltransferase  51.38 
 
 		 273 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0080  serine acetyltransferase  52.34 
 
 		 273 aa  269  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4080  serine acetyltransferase  51.16 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0172  serine acetyltransferase  50 
 
 		 271 aa  262  4.999999999999999e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0438  serine O-acetyltransferase  52 
 
 		 266 aa  255  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4170  Serine O-acetyltransferase  51.6 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1548  serine O-acetyltransferase  48.45 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000499697  hitchhiker  0.000167756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0921  serine O-acetyltransferase  47.45 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0534835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1437  Serine O-acetyltransferase  46.85 
 
 		 280 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87889  serine acetyl transferase  46.83 
 
 		 374 aa  244  8e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0880  serine O-acetyltransferase  47.22 
 
 		 264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0527  Serine O-acetyltransferase  46.77 
 
 		 288 aa  238  9e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1806  serine O-acetyltransferase  45.67 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.615997  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1336  serine O-acetyltransferase  49.62 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0595  serine O-acetyltransferase  45.49 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1176  serine O-acetyltransferase  50.6 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  0.057909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0941  serine O-acetyltransferase  44.92 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3685  serine O-acetyltransferase  51.36 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.189404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4370  serine O-acetyltransferase  47.43 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.844031  normal  0.0891787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0860  serine O-acetyltransferase  46.27 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0103482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_5580  predicted protein  46.77 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000587392  normal  0.0596868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3386  serine O-acetyltransferase  51.36 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.224219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4892  serine O-acetyltransferase  46.59 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1551  serine O-acetyltransferase  49.4 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.11379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1429  serine O-acetyltransferase  49.41 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000018567 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46665  predicted protein  42.75 
 
 		 539 aa  208  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710949  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44289  predicted protein  42.23 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00762674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54880  putative serine acetyltransferase  43.8 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000008722  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1439  serine acetyltransferase protein  40.31 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.247576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  49.12 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  46.49 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  51.22 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  49.71 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  49.43 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2405  putative serine acetyltransferase  38.91 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>