More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2370 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  83.29 
 
 
389 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
389 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  86.38 
 
 
389 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  85.86 
 
 
390 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  78.41 
 
 
389 aa  658    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  76.35 
 
 
433 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  64.78 
 
 
395 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.1 
 
 
391 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  64.52 
 
 
389 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.3 
 
 
391 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  64.27 
 
 
389 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  64.87 
 
 
390 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.87 
 
 
389 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  62.98 
 
 
389 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.98 
 
 
388 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.05 
 
 
390 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.59 
 
 
392 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.54 
 
 
389 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.93 
 
 
392 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.79 
 
 
390 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.1 
 
 
391 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  61.54 
 
 
390 aa  501  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.03 
 
 
390 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  60.87 
 
 
391 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.74 
 
 
390 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.28 
 
 
393 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  59.74 
 
 
390 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  60.61 
 
 
391 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.74 
 
 
390 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.29 
 
 
392 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.16 
 
 
398 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  60.51 
 
 
391 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  59.23 
 
 
386 aa  478  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.06 
 
 
397 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.08 
 
 
390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.08 
 
 
390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  59.08 
 
 
390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.41 
 
 
405 aa  455  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  55.1 
 
 
399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  56.27 
 
 
394 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  56.27 
 
 
394 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  56.27 
 
 
394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.1 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.85 
 
 
389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.82 
 
 
390 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.05 
 
 
401 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.79 
 
 
401 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.33 
 
 
396 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.08 
 
 
388 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  51.92 
 
 
389 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1366  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  52.7 
 
 
452 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3017  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.96 
 
 
520 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3146  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.96 
 
 
520 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 
388 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.74 
 
 
388 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 
388 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5460  alcohol dehydrogenase  53.98 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.21 
 
 
389 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  48.46 
 
 
384 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.31 
 
 
386 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.34 
 
 
389 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.94 
 
 
384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.68 
 
 
384 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.19 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.57 
 
 
385 aa  356  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.06 
 
 
385 aa  355  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.72 
 
 
389 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.94 
 
 
384 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.8 
 
 
387 aa  348  8e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  47.33 
 
 
388 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 
400 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  45.8 
 
 
388 aa  346  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  46.82 
 
 
385 aa  345  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.13 
 
 
392 aa  342  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.31 
 
 
400 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.9 
 
 
390 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.01 
 
 
376 aa  339  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  45.55 
 
 
400 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00340  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.77 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.349198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.29 
 
 
412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  46.65 
 
 
415 aa  335  5.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554879  normal  0.833214 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  45.04 
 
 
412 aa  335  9e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  45.04 
 
 
412 aa  335  9e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.78 
 
 
412 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  45.55 
 
 
412 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 
412 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3437  alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 
391 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  45.55 
 
 
412 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.78 
 
 
412 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.04 
 
 
411 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  45.55 
 
 
412 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  44.42 
 
 
396 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.55 
 
 
412 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  45.55 
 
 
412 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.78 
 
 
412 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  45.04 
 
 
388 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.78 
 
 
393 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.62 
 
 
382 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  44.53 
 
 
411 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.78 
 
 
393 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>