27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2045 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  86.67 
 
 		 135 aa  246  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  87.41 
 
 		 135 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  71.85 
 
 		 152 aa  204  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  71.85 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  70.37 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  49.63 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  45.8 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  40.46 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  42.97 
 
 		 360 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  41.98 
 
 		 349 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  35.56 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  39.69 
 
 		 355 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  37.78 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  37.12 
 
 		 356 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  34.59 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  33.83 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  38.46 
 
 		 355 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  36.64 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.59 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.08 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  36.51 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  36.56 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  30.71 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  28.24 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>