61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1474 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 		 157 aa  328  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  53.85 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04779  hypothetical protein  43.4 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05658  hypothetical protein  43.4 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  46.21 
 
 		 268 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  42.14 
 
 		 250 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3794  hypothetical protein  43.24 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.8 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.04 
 
 		 260 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 		 263 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 257 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1683  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.56 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3089  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.62 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143848  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6786  hypothetical protein  36.62 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0558411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.36 
 
 		 270 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.31 
 
 		 288 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  39.19 
 
 		 263 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 250 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 250 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 250 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0702  hypothetical protein  35.62 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.900937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.71 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0746  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.79 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02030  hypothetical protein  33.63 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04693  hypothetical protein  27.34 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111587  normal  0.54865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1084  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.9 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1469  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001194  2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase component  28.19 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0674  hypothetical protein  55.81 
 
 		 53 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4050  activator of Hsp90 ATPase-like protein  26.75 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0223  hypothetical protein  48.08 
 
 		 53 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2557  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.1 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0707  hypothetical protein  48.08 
 
 		 53 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.933221  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2989  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.77 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2422  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.34 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0850006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2670  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.48 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.158608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3783  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1609  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.5 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3233  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.67 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0217  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.8 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.12 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1839  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  25.18 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2766  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0483  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.4 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506287 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04982  hypothetical protein  26.03 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0626  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.95 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4111  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.53 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22380  hypothetical protein  27.54 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.14979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4031  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.12 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1234  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.63 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  24.06 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0246277  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1306  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3385  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.35 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.21 
 
 		 148 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0906319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0384  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.36 
 
 		 274 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0405  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.36 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0396  activator of Hsp90 ATPase 1-like protein  25.36 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1783  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.19 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.0116667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>