29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0965 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  100 
 
 		 561 aa  1106    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  63.83 
 
 		 540 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  68.54 
 
 		 547 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  66.53 
 
 		 565 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  57.75 
 
 		 600 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  56.39 
 
 		 538 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  60.89 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  43.7 
 
 		 474 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  40.95 
 
 		 485 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  40 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  38.83 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  35.9 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  36.32 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  36.32 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  35 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  37.35 
 
 		 409 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  36.79 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  36.28 
 
 		 408 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  33.47 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  39.02 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  32.65 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  35.41 
 
 		 403 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  36.84 
 
 		 372 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  37.9 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  30.89 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  26.55 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  32.56 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  24.31 
 
 		 336 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  24.31 
 
 		 336 aa  43.5  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>