16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4224 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  100 
 
 		 821 aa  1634    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  84.22 
 
 		 828 aa  1402    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  59.16 
 
 		 827 aa  929    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  30.62 
 
 		 812 aa  323  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  31.11 
 
 		 818 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  32.9 
 
 		 819 aa  312  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  29.53 
 
 		 783 aa  281  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  27.01 
 
 		 766 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  24.78 
 
 		 806 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  23.19 
 
 		 889 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  31.71 
 
 		 681 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2591  hypothetical protein  40.58 
 
 		 106 aa  55.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000151493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  22.22 
 
 		 692 aa  54.3  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  29.68 
 
 		 875 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  26.44 
 
 		 837 aa  45.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  29.03 
 
 		 226 aa  44.3  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>