15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3992 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3992  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1256    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3345  hypothetical protein  78.85 
 
 		 664 aa  835    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2913  hypothetical protein  43.25 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1235  hypothetical protein  42.38 
 
 		 650 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.767202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2408  hypothetical protein  27.54 
 
 		 526 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1207  hypothetical protein  30.94 
 
 		 518 aa  96.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4240  hypothetical protein  29.93 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1075  hypothetical protein  21.88 
 
 		 744 aa  61.2  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0202284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0468  hypothetical protein  28.87 
 
 		 516 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.633748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0822  hypothetical protein  28.38 
 
 		 528 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4381  hypothetical protein  25.9 
 
 		 518 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4443  hypothetical protein  25.9 
 
 		 518 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.315407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1738  hypothetical protein  30.63 
 
 		 578 aa  47.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.568189  normal  0.233256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0449  hypothetical protein  30.43 
 
 		 509 aa  44.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.727643  normal  0.216605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3004  hypothetical protein  30.7 
 
 		 439 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.104415  normal  0.411209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>