13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0468 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4240  hypothetical protein  84.91 
 
 
502 aa  823    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0468  hypothetical protein  100 
 
 
516 aa  1025    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.633748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0822  hypothetical protein  45.06 
 
 
528 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4942  hypothetical protein  35.84 
 
 
499 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3687  hypothetical protein  30.85 
 
 
504 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.573488  hitchhiker  0.004724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3112  hypothetical protein  28.12 
 
 
469 aa  97.1  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2588  hypothetical protein  29.34 
 
 
596 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00892786  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1235  hypothetical protein  28.41 
 
 
650 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.767202  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2913  hypothetical protein  25.91 
 
 
661 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2408  hypothetical protein  27.1 
 
 
526 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1075  hypothetical protein  21.9 
 
 
744 aa  51.6  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0202284  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0449  hypothetical protein  24.57 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.727643  normal  0.216605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0766  hypothetical protein  22.69 
 
 
714 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>