13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4240 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4240  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  989    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0468  hypothetical protein  84.91 
 
 		 516 aa  800    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.633748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0822  hypothetical protein  44.62 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4942  hypothetical protein  35.06 
 
 		 499 aa  153  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3687  hypothetical protein  30.6 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.573488  hitchhiker  0.004724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3112  hypothetical protein  25.5 
 
 		 469 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2588  hypothetical protein  29.66 
 
 		 596 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00892786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1235  hypothetical protein  29.43 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.767202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2913  hypothetical protein  29.12 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0766  hypothetical protein  23.47 
 
 		 714 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1075  hypothetical protein  22.94 
 
 		 744 aa  47.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0202284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2408  hypothetical protein  31.58 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0449  hypothetical protein  25.71 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.727643  normal  0.216605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>