14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2913 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2913  hypothetical protein  100 
 
 
661 aa  1312    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1235  hypothetical protein  58.57 
 
 
650 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.767202  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3992  hypothetical protein  42.86 
 
 
647 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3345  hypothetical protein  41.76 
 
 
664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1207  hypothetical protein  27.29 
 
 
518 aa  70.5  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2408  hypothetical protein  26.3 
 
 
526 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4240  hypothetical protein  29.12 
 
 
502 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0822  hypothetical protein  29.94 
 
 
528 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4381  hypothetical protein  25.56 
 
 
518 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4443  hypothetical protein  25.56 
 
 
518 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.315407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0468  hypothetical protein  27.93 
 
 
516 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.633748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3687  hypothetical protein  27.82 
 
 
504 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.573488  hitchhiker  0.004724 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1075  hypothetical protein  22.73 
 
 
744 aa  51.6  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0202284  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0449  hypothetical protein  36.64 
 
 
509 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.727643  normal  0.216605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>