27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2883 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  275  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  84.29 
 
 		 140 aa  240  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  40.15 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  37.4 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  35.88 
 
 		 349 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.93 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  39.52 
 
 		 360 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  39.83 
 
 		 356 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  38.17 
 
 		 355 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  33.83 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  35.43 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  34.92 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  35.43 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.86 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  36.15 
 
 		 355 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  36.64 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.84 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  34.35 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  32.82 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  33.59 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  32.82 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  32.82 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  30.53 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  28.12 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0536  hypothetical protein  27.88 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.368426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  28.24 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  26.96 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>