45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1696 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1696  FHA domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2321  FHA domain-containing protein  88.11 
 
 
185 aa  332  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.380377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1918  FHA domain containing protein  42.27 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  34.83 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  36.25 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  35.71 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  36.9 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.11 
 
 
554 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3415  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.11 
 
 
554 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  30.95 
 
 
241 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.04 
 
 
554 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  35.14 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  32.86 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2922  hypothetical protein  36.11 
 
 
265 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0126105  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  36.59 
 
 
591 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  32.86 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  30.37 
 
 
1488 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  34.85 
 
 
134 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  36.76 
 
 
224 aa  45.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2985  hypothetical protein  31.73 
 
 
249 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0275079  hitchhiker  0.000737309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  45.1  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  37.21 
 
 
245 aa  45.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  29.35 
 
 
267 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  33.04 
 
 
1011 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3181  FHA domain-containing protein  34.44 
 
 
302 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.999719  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  33.66 
 
 
326 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  35.63 
 
 
440 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.206404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  34.85 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  33.66 
 
 
326 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  32.98 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  32.61 
 
 
444 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  34.94 
 
 
1108 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  35 
 
 
245 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  30.34 
 
 
1481 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  28.41 
 
 
1065 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  32.58 
 
 
175 aa  41.6  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  30 
 
 
770 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0140  FHA domain-containing protein  35.16 
 
 
533 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425814  hitchhiker  0.00649643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  28.75 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  32.67 
 
 
338 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  55.56 
 
 
234 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  37.18 
 
 
253 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0024  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
280 aa  41.2  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>