15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4555 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4555    100 
 
 		 237 bp  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0946294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  86.59 
 
 		 1542 bp  165  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 576 bp  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    83.73 
 
 		 1556 bp  145  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    85.09 
 
 		 1540 bp  129  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6811    86.92 
 
 		 2852 bp  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  82.3 
 
 		 1389 bp  121  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  82.86 
 
 		 1539 bp  87.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  81.44 
 
 		 1647 bp  85.7  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  85.57 
 
 		 1539 bp  81.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  80.7 
 
 		 1602 bp  77.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  84.04 
 
 		 1533 bp  67.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  85.14 
 
 		 1518 bp  60  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  85.14 
 
 		 1518 bp  60  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  82.11 
 
 		 1548 bp  54  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>