66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4181 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  89.68 
 
 		 126 aa  237  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  74.6 
 
 		 127 aa  203  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  70.63 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  69.05 
 
 		 124 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  60.8 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  62.7 
 
 		 127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  64.29 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  61.11 
 
 		 127 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  61.11 
 
 		 127 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  61.11 
 
 		 127 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  61.11 
 
 		 127 aa  167  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  65.08 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  60.32 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  61.6 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  58.73 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  58.73 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  60 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  60 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  60 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  57.14 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  47.62 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  47.58 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  51.56 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  53.12 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  52.34 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  48.41 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  48.8 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  45.97 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  43.65 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  41.8 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  42.4 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  36 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  33.06 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  36 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  34.96 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  33.59 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  34.71 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.71 
 
 		 244 aa  81.3  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  33.6 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  30.47 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  30.47 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  30.47 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  32.06 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  33.86 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  32 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  31.25 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  31.2 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  33.6 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  33.6 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  29.6 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0609  tautomerase  30.58 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  29.03 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  25.96 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  24.39 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>