More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0680 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  55.28 
 
 		 690 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  53.36 
 
 		 738 aa  708    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  55.8 
 
 		 679 aa  710    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  61.61 
 
 		 691 aa  847    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  61.84 
 
 		 692 aa  859    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  62.24 
 
 		 686 aa  882    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  83.99 
 
 		 682 aa  1195    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  54.44 
 
 		 683 aa  714    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  61.99 
 
 		 704 aa  862    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  62.26 
 
 		 714 aa  896    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  55.51 
 
 		 679 aa  740    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  52.41 
 
 		 684 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  57.39 
 
 		 678 aa  754    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  53.7 
 
 		 687 aa  720    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  57.82 
 
 		 802 aa  793    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  55.35 
 
 		 690 aa  750    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  74.82 
 
 		 685 aa  1050    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  54.55 
 
 		 686 aa  668    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  53.73 
 
 		 678 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  100 
 
 		 716 aa  1477    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  55.2 
 
 		 690 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  53.46 
 
 		 680 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  55.82 
 
 		 681 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.34 
 
 		 682 aa  712    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  55.8 
 
 		 679 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  54.97 
 
 		 680 aa  737    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  62.5 
 
 		 689 aa  892    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  55.8 
 
 		 699 aa  735    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  53.85 
 
 		 681 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  53.46 
 
 		 680 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  53.46 
 
 		 680 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  53.73 
 
 		 680 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  53.3 
 
 		 680 aa  708    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  49.33 
 
 		 645 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  47.34 
 
 		 642 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  46.24 
 
 		 652 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  43.81 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  44.66 
 
 		 647 aa  539  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  43.35 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  44.02 
 
 		 647 aa  536  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  45.24 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  45.06 
 
 		 676 aa  506  9.999999999999999e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  55.12 
 
 		 846 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  31.56 
 
 		 650 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  31.91 
 
 		 600 aa  259  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.09 
 
 		 587 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  28.5 
 
 		 583 aa  179  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.82 
 
 		 577 aa  179  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  27.66 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.57 
 
 		 576 aa  171  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.57 
 
 		 576 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.03 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.52 
 
 		 566 aa  157  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.78 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.6 
 
 		 542 aa  154  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.04 
 
 		 566 aa  154  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.27 
 
 		 539 aa  150  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  28.65 
 
 		 598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  27.42 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  26.22 
 
 		 574 aa  146  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  24.82 
 
 		 575 aa  144  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  27.44 
 
 		 611 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  28.22 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  27.77 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.69 
 
 		 540 aa  141  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  26.73 
 
 		 552 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.3 
 
 		 543 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  26.26 
 
 		 540 aa  137  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  26.26 
 
 		 540 aa  138  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  26.26 
 
 		 540 aa  138  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  26.55 
 
 		 538 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  26.68 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  28.9 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.41 
 
 		 658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  26.25 
 
 		 540 aa  136  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.21 
 
 		 597 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  27 
 
 		 562 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  27.13 
 
 		 565 aa  134  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.45 
 
 		 552 aa  134  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  28.55 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.66 
 
 		 577 aa  132  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.48 
 
 		 548 aa  132  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.76 
 
 		 577 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  23.81 
 
 		 543 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  28.11 
 
 		 550 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  26.97 
 
 		 586 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.54 
 
 		 571 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  27 
 
 		 591 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  27.95 
 
 		 599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  27.43 
 
 		 564 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  27.34 
 
 		 584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  27.79 
 
 		 541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.3 
 
 		 686 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  25.51 
 
 		 561 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  26.41 
 
 		 544 aa  127  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  28.79 
 
 		 571 aa  127  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  27.49 
 
 		 545 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  27.1 
 
 		 688 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.84 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  25.34 
 
 		 561 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>