32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6932 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 131 aa  244  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  93.89 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  77.78 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  80.8 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  80.49 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  60.64 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  62.79 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  69.89 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  60.55 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  67.12 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  63.91 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  45.88 
 
 		 221 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  44.71 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  42.35 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  52.68 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  47.15 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  53.78 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  35.16 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  35.94 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  34.92 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  34.92 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  44.29 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  38.57 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  38.57 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  44.93 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  39.62 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  29.85 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  36.67 
 
 		 466 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>